建设工程消防验收意见书由住房和城乡建设主管部门出具。根据《中华人民共和国消防法》规定，特殊建设工程竣工后，建设单位应当向住房和城乡建设主管部门申请消防验收；其他建设工程，建设单位在验收后应当报住房和城乡建设主管部门备案，住房和城乡建设主管部门应当进行抽查。住房和城乡建设主管部门承担这一职责，是因为消防工程作为建设工程的重要组成部分，与整体工程的施工质量和安全密切相关。在施工阶段，消防设施的安装、施工质量直接影响到后续的消防验收结果。施工单位需要按照消防设计文件和相关标准、规范进行施工，确保消防设施的种类、规格、数量以及安装位置等符合要求。住房和城乡建设主管部门对施工过程也会进行监管，以保证施工质量。在验收环节，住房和城乡建设主管部门会依据相关法律法规、技术标准和消防设计文件等，对建设工程的消防设施进行全面检查和测试，包括消防给水系统、火灾自动报警系统、消防供电系统等。经检查和测试，若建设工程的消防设施符合要求，住房和城乡建设主管部门会出具建设工程消防验收合格意见书；若不符合要求，则会出具消防验收不合格意见书，并提出整改意见，要求建设单位整改后重新申请验收。总之，住房和城乡建设主管部门凭借其对建设工程施工和消防规范的专业了解，承担起出具建设工程消防验收意见书的重要职责，以保障建设工程的消防安全。